Permasalahan antara dunia sihir dan Kota Akademi semakin memanas, Kamijo Touma harus terus berhadapan dengan Esper maupun Magician untuk melindungi orang-orang yang berharga baginya, khususnya Librorum Prohibitorum Index, yang selalu diincar oleh organisasi-organisasi yang mengincar Librorum Prohibitorum didalam ingatannya Index. Walaupun begitu, tentu saja Touma tidak sendiri. Teman-temannya dari Akademi yang selalu mendukungnya untuk menyelesaikan masalah yang tak kunjung usai. Apa yang akan terjadi selanjutnya?
